Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clk2O35491 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Clk2O35491 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Clk2O35491 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clk2O35491 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Clk2O35491 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clk2O35491 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clk2O35491 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Clk2O35491 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Clk2O35491 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Clk2O35491 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Clk2O35491 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Clk2O35491 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk2O35491 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Clk2O35491 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk2O35491 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk2O35491 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms