Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms