Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf5O35326 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf5O35326 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf5O35326 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf5O35326 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf5O35326 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Srsf5O35326 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf5O35326 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Srsf5O35326 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf5O35326 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf5O35326 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf5O35326 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf5O35326 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf5O35326 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf5O35326 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf5O35326 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf5O35326 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf5O35326 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf5O35326 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf5O35326 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf5O35326 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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