Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr1aO35134 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms