Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms