Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EllO08856 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EllO08856 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EllO08856 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms