Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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