Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms