Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms