Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5849J3QPE5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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