Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm20795J3QP49 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm20795J3QP49 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Gm20795J3QP49 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm20795J3QP49 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm20795J3QP49 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm20795J3QP49 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20795J3QP49 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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