Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim18J3QNP2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms