Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms