Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms