Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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