Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm3415J3QMS8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm3415J3QMS8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm3415J3QMS8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm3415J3QMS8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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