Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm20873J3QMQ9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm20873J3QMQ9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm20873J3QMQ9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm20873J3QMQ9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm20873J3QMQ9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Gm20873J3QMQ9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm20873J3QMQ9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm20873J3QMQ9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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