Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms