Protein–RNA interactions for Protein: J3QK78

Gm3139, Predicted gene 3139, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3139J3QK78 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm3139J3QK78 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm3139J3QK78 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3139J3QK78 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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