Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21060J3KMU4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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