Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21897J3KMP5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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