Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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