Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms