Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc4lG5E8X2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms