Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms