Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc6F8VPZ5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms