Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Syngap1F6SEU4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms