Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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