Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd7E9Q9W7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms