Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DspE9Q557 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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DspE9Q557 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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DspE9Q557 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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DspE9Q557 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms