Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm3020E9Q3J7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3020E9Q3J7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Gm3020E9Q3J7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Gm3020E9Q3J7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm3020E9Q3J7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm3020E9Q3J7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3020E9Q3J7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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