Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Pdzd2E9Q1M1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Pdzd2E9Q1M1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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