Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms