Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms