Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan18E9PUD6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan18E9PUD6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan18E9PUD6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan18E9PUD6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan18E9PUD6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan18E9PUD6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan18E9PUD6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan18E9PUD6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan18E9PUD6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan18E9PUD6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan18E9PUD6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan18E9PUD6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan18E9PUD6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan18E9PUD6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms