Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms