Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms