Protein–RNA interactions for Protein: D3YX25

Gm7257, Predicted gene 7257, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7257D3YX25 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm7257D3YX25 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm7257D3YX25 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms