Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Catsperg2C6KI89 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms