Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms