Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms