Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms