Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clrn2B2RVW2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms