Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PtprbB2RU80 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PtprbB2RU80 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PtprbB2RU80 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
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PtprbB2RU80 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PtprbB2RU80 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PtprbB2RU80 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PtprbB2RU80 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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