Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms