Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf3B2RQG2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms