Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm2012B1B0R1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms