Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NhsB1AV60 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms