Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms