Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1aA2APX8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1aA2APX8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms